Le Conservatoire est investi, depuis de nombreuses années, dans le schéma d'éducation des enfants.

Soit dès le plus jeune âge au sein de l'école, sur le temps scolaire, pour un éveil à la musique et à la danse pour lequel la Ville de Lyon lui a confié la mission d'orchestrer l'intervention en milieu scolaire, soit pour permettre à des enfants et adolescents montrant une forte motivation pour la pratique artistique de poursuivre leur scolarité en Classes à Horaires Aménagés dans les conditions les plus satisfaisantes des classes primaires jusqu' au bac TMD. Le conservatoire a également mis en place avec le lycée de Saint-Just des aménagements d'horaires pour les lycéens préparant un bac littéraire ou scientifique, dans le cadre des classes Temp_O

Ces missions sont construites avec des liens pédagogiques privilégiés avec l'Education Nationale.

Depuis 2015, le Conservatoire  organise avec le service Education de la Ville de Lyon une offre périscolaire  qui s'inscrit dans le cadre du PEDT (Projet Educatif de Territoire).